Την ενοχή του πατρός Αντωνίου για πράξεις που αφορούν σε σωματικές κακοποίησεις ανηλίκων τροφίμων της Κιβωτού του Κόσμου, αποφάσισε το Τριμελές Πλημμελειοδικείο της Αθήνας.
Το δικαστήριο αποφάσισε να κρίνει ένοχο τον πατέρα Αντώνιο για δύο πράξεις που αφορούν σωματική βλάβη και τρεις πράξεις που αφορούν ηθική αυτουργία σε σωματική βλάβη και απειλή.
Το δικαστήριο υιοθέτησε στα βασικά της σημεία την πρόταση της εισαγγελέως η οποία είχε ζητήσει ο πατέρας Αντώνιος να κριθεί ένοχος για περιστατικά κακοποιητικών συμπεριφορών που έλαβαν χώρα, στο Βόλο και τη Χίο και, συγκεκριμένα, για πέντε πράξεις φυσικής και ηθικής αυτουργίας.
Παράλληλα, είχε εισηγηθεί την απαλλαγή του ιδρυτή της οργάνωσης, για σειρά επιμέρους αδικημάτων όπως της ηθικής αυτουργίας σε απειλή. Το δικαστήριο από τους οκτώ κατηγορούμενους αθώωσε πλήρως τους τρεις.